伊斯兰教自创立以来，因领袖传承、教义阐释等差异形成诸多教派，其中逊尼派与什叶派是最核心、影响力最大的两大分支，占据全球穆斯林人口的绝大多数。
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逊尼派是伊斯兰教主流教派，约占全球穆斯林总数的85%-90%，“逊尼”意为遵循先知穆罕默德的圣训。该派主张穆斯林共同体协商推选宗教领袖，认可四大正统哈里发的合法性，以《古兰经》和圣训为核心经典，宗教权威分散，教法体系完善，是中东、北非、南亚等地区多数国家的主流教派。什叶派约占全球穆斯林10%-15%，“什叶”意为阿里的追随者，坚持领袖必须是先知穆罕默德的直系后裔，尊崇伊玛目为神圣宗教领袖，主要分布在伊朗、伊拉克等地区。两派核心信仰一致，分歧集中在领袖传承与宗教仪式细节。
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在中国，伊斯兰教始终遵循本土化发展道路，教派格局清晰且和谐稳定，绝大多数穆斯林信奉逊尼派，仅极少数群体信仰什叶派。
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新疆作为多民族聚居地区，维吾尔、哈萨克、柯尔克孜、乌孜别克、塔塔尔等民族，均信奉逊尼派，教法上遵循哈乃斐学派，这也是中国伊斯兰教的主流教法体系。这些民族的宗教信仰与生活习俗深度融合，恪守宗教教义，同时与中华传统文化兼容并蓄。唯一特殊的是塔吉克族，主要聚居在新疆塔什库尔干地区，信奉什叶派中的伊斯玛仪派，宗教仪式简约，形成了独具特色的信仰传统。此外，新疆伊斯兰教还存在苏非派分支，是本土化发展的重要体现，各教派彼此尊重、和睦共处。
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回族是我国人口较多的信仰伊斯兰教的民族，全体信奉逊尼派，无什叶派信众。回族内部形成了格底目、伊赫瓦尼、西道堂等本土化教派，以及四大门宦等传承形式，均隶属于逊尼派体系。其中格底目是回族最主流、历史最悠久的教派，坚守传统教义，融合中华伦理；伊赫瓦尼、西道堂等则是不同历史时期本土化发展的产物，均倡导爱国爱教、温和包容。回族穆斯林遍布全国，其信仰实践始终与国家法律、社会秩序相契合。
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逊尼派宗教权威分散、注重世俗秩序，与我国儒家伦理、大一统治理高度兼容。回族形成的格底目、伊赫瓦尼等本土教派，新疆的苏非传统，均在逊尼派框架内发展，融合了敬祖、和顺、爱国等理念。这种包容性让伊斯兰教顺利完成中国化，而什叶派强调血统传承与宗教集权，难以适应中国社会结构，因此始终未能普及。
